冷却水中有大量的微生物在冷却水设备的管壁上产生和繁殖，不仅大大增加了水流的摩擦阻力，造成管道堵塞，而且严重降低了换热器的换热率。同时，还会造成危险点腐蚀，造成管道穿孔。

为了控制这些微生物的危害，必须在循环冷却水系统中添加杀菌剂、污泥剥离剂等药物，以杀灭和抑制微生物的生长繁殖。

杀菌剂通常分为氧化杀菌剂和非氧化杀菌剂。氧化杀菌剂通常是一种强氧化剂，能通过与次生物质的氧化作用，利用次氯酸盐、原子氧等微生物杀灭微生物。这种杀菌剂通常是无机化合物。氯用途广泛。在消毒过程中，氯能使微量有机物氯化。这些氯化有机物的毒性会使微生物中毒。由于其杀菌力强、原料易得、使用简单，仍被广泛应用。

二氧化氯是另一种无机化合物，是一种比氯强2.6倍的强氧化剂。它被用作冷却水中的杀菌剂。与氯相比，它具有剂量小、反应快、效果好、不与氨反应、不受pH影响等优点。近年来，二氧化氯取代了一些氨厂、石化厂和炼油厂的氯，以控制工业冷却水系统中微生物的生长。二氧化氯具有很长的杀灭循环。在12小时内，0.5ppm二氧化氯对异氧细菌的杀菌能力为99.9%。二氧化氯处于氯相中。对人体危害极大，刺激眼睛和呼吸器官。当浓度高时，会刺激中枢神经系统，导致死亡。

非氧化杀菌剂主要是有机化合物。例如，醛类、硝酸盐、盐类、咪唑啉和其他杂质：比较器、长链胺、季铵盐和含卤素的有机化合物。其中五氯酚钠和西维因应用广泛。

可见，杀菌剂和除藻剂种类繁多，功能也十分丰富。

 很多离不开水的生产企业都会遇到同一个难题，那就是工业用水长藻，水中长藻会影响循环水系统的运行，各种藻类产生的粘泥还会堵塞管道。为了能够使循环水系统正常的运转建议企业使用工业杀菌灭藻剂。

 工厂使用的循环水系统都会有金属设备和管道，所以在进行杀菌灭藻时要使用非氧化性的灭藻剂，因为非氧化性灭藻剂不会对金属产生腐蚀性，常用有1227和异噻唑啉酮。
 水中不仅蓝藻、绿藻等藻类还有大量的细菌，工业杀菌灭藻剂对水中存在的一切有害物质都会强力的杀灭，持续的药效能够抑制它们的生长；灭藻剂的使用PH范围很广、成本低、使用方便。
 工业杀菌灭藻剂对循环水有长效的治理效果，通过灭藻剂的作用可以提高水资源的利用率，进一步降低企业的成本。